На одном из моих сайтов я использовал международный домен. Со временем решил перейти на домен в зоне .ru. После смены домена сайт перестал правильно отображаться в панели управления сервиса "Яндекс Вебмастер".

Проблема оказалась в настройках файла robots.txt. Файл с настройками по умолчанию для версии Joomla 3.8.6 выглядит так:

User-agent: *
Disallow: /administrator/
Disallow: /bin/
Disallow: /cache/
Disallow: /cli/
Disallow: /components/
Disallow: /includes/
Disallow: /installation/
Disallow: /language/
Disallow: /layouts/
Disallow: /libraries/
Disallow: /logs/
Disallow: /modules/
Disallow: /plugins/
Disallow: /tmp/

Хранятся настройки по умолчанию в главном каталоге сайта, в файле robots.txt.dist. Ранее, задолго до смены домена, я изменил файл robots.txt, добавил инструкцию:

Disallow: /*mailto/

И ещё создал группу инструкций отдельно для робота Яндекс:

User-agent: Yandex
Disallow: /administrator/
Disallow: /cache/
Disallow: /cli/
Disallow: /components/
Disallow: /includes/
Disallow: /installation/
Disallow: /language/
Disallow: /libraries/
Disallow: /logs/
Disallow: /media/
Disallow: /modules/
Disallow: /plugins/
Disallow: /templates/
Disallow: /tmp/
Disallow: /*mailto/
Host: my-sait.org
Sitemap: http://my-sait.org/sitemap.xml

И вот теперь, после смены домена, для правильного отображения сайта в "Яндекс Вебмастере" нужно заменить домен в инструкциях "Host" и "Sitemap".